Студопедия
Случайная страница | ТОМ-1 | ТОМ-2 | ТОМ-3
АвтомобилиАстрономияБиологияГеографияДом и садДругие языкиДругоеИнформатика
ИсторияКультураЛитератураЛогикаМатематикаМедицинаМеталлургияМеханика
ОбразованиеОхрана трудаПедагогикаПолитикаПравоПсихологияРелигияРиторика
СоциологияСпортСтроительствоТехнологияТуризмФизикаФилософияФинансы
ХимияЧерчениеЭкологияЭкономикаЭлектроника

В стационарном режиме

Читайте также:
  1. БИПОЛЯРНЫЙ ТРАНЗИСТОР В РЕЖИМЕ УСИЛЕНИЯ
  2. В режиме автономной работы
  3. Внешняя характеристика трансформатора. Падение напряжения в номинальном режиме.
  4. ВОЗБУЖДЕНИЕ ТЯГОВОГО ГЕНЕРАТОРА В РЕЖИМЕ ХОЛОСТОГО ХОДА
  5. Выбор мощности при кратковременном режиме работы двигателя
  6. Глава 5. Порядок эксплуатации тормозов в технологическом (рабочем) режиме.

требуемое число –РНК (за время t = 10 мин = 600 с)

(–РНК) = (+РНК) /(t*(vРЕП/ lРЕП–)) = 104/300 = 33

его можно представить и как

(–РНК) = v+РНК/(vРЕП/ lРЕП–) = v+РНК lРЕП–/vРЕП,

где v+РНК = d(+РНК)/dt

и общее число РЕП

РЕП = (–РНК) N РЕП– = (–РНК) lРНК/ lРЕП– = 33*33 = 1000,

где lРНК= 3569 н. – длина РНК, N РЕП– = lРНК/ lРЕП– = 3569/108 = 33 – число репликаз на –РНК.

Синтез –РНК:

d(–РНК)/dt = (+РНК) vРЕП/ lРЕП+ = v (+РНК) (4)

Скорости v+ = vРЕП/ lРЕП– и v = vРЕП/ lРЕП+, введенные уравнениями (3) и (4) как скорости синтеза +РНК и –РНК – это одновременно и скорости посадки на них репликаз (в силу квазистационарности концентраций +РНК и –РНК) с запаздыванием на время синтеза.

Например, если определить v+ как скорость посадки на –РНК при синтезе +РНК, а vРЕП/ lРЕП– как скорость собственно синтеза +РНК, то условие квазистационарности по севшим репликазам (сколько село, столько и синтезировалось: v+ (–РНК) = d(+РНК)/dt = v+РНК = vРЕП/ lРЕП– (–РНК)) означает, что v+ = vРЕП/ lРЕП– (но с запаздыванием на время синтеза).

 

Для скорости посадки репликаз используем соотношения вида

при синтезе +РНК (посадка на –РНК)

v+ = k+ РЕП/(РЕП + K+) (5)

при синтезе –РНК (посадка на +РНК)

v = k РЕП/(РЕП + K) (6)

 

Дальнейшие шаги:

(М) относительная кинетика: исключение времени (как результат деления кинетических уравнений), позволяет анализировать относительные изменения концентраций (решая дифференциальные уравнения).

Так можно анализировать многие важные взаимосвязи в данной задаче, выбирая пару в зависимости от того, какое соотношение важно.

Дальше воспользуемся несколькими из таких возможностей, но сначала рассмотрим более простой вариант использования связей, следующих из относительной кинетики, сразу получая ориентирующие (грубые) оценки

 

· относительная оценка: соотношение +РНК и –РНК, рассчитанное в стационарном режиме, кинетически нереализуемо

Пример важной ориентирующей оценки получим, принимая, что соотношение концентраций +РНК и –РНК равно рассчитанному в стационарном режиме (6000/33, т.е. около 200), а их изменения порядка самих концентраций (т.е. соотношение изменений является таким же).

Такая оценка отношения будет довольно точной, если кинетики этих двух концентраций подобны.

При такой оценке из уравнений (3) и (4) отношение

v+ / v= (+РНК)2/(–РНК)2 = 2002

т.е. v+ / v порядка 40000.

Тогда даже если v+ принимает свое максимальное значение 0,5 с–1 (определяемое тем, что репликазы, как и рибосомы на РНК разделяет расстояние в десятки нуклеотидов), то получаем, что время посадки на –РНК составляет не менее 80000 с, что очевидно противоречит реально наблюдаемой кинетике. В этом случае за время эксперимента на исходную +РНК с запасом более, чем порядок, не сядет ни одна репликаза, а значит, не будет синтезировано и ни одной +РНК дополнительно к исходной.

(!) нелинейность кинетики нужно анализировать особо, но в любом случае следует ожидать коррекцию количественных соотношений в сравнении с оценкой на 1-м шаге: дискриминация в 2–3 порядка – это многократная потеря темпа в кинетике на начальном этапе (порядка 1000 минут)

 


Дата добавления: 2015-07-16; просмотров: 129 | Нарушение авторских прав


<== предыдущая страница | следующая страница ==>
Проблемы теоретического анализа и количественного описания| Семинар 3.

mybiblioteka.su - 2015-2024 год. (0.005 сек.)