Лабораторна робота. «Програма МОРАС, та її можливості»

20.03.12

«Програма МОРАС, та її можливості»

Мета: освоїти програму МОРАС, та її функції.

Хід роботи:

1. Побудувати молекулу в Hyper Chem.
2. Виконати оптимізацію.
3. Зберегти дані у вигляді.zmt-матриці.
4. За допомогою NotePad відредагувати.zmt-матрицю. Додати потрібні ключові слова в командний рядок.
5. Зберегти її для подальшого використання.
6. Виконати розрахунки за допомогою МОРАС.
7. Перевірити результати розрахунків, записавши отримані матриці в форматі zmt-матриці і розглянувши їх в Hyper Chem.
8. Побудувати криву залежності «Енергія – відстань»
9. Зробити висновки.

Отримані результати:

1.Створення молекули в програмі Hyper Chem:

Оптимізація будови напівемпіричним методом АМ1:

Оптимізація геометрії:

Вигляд zmt-матриці, яка використовувалась при розрахунках:

_____________________________________________________________________________________

AM1 GEO-OK BONDS NOXYZ NOINTER NOLOG DUMP=3600 T=3600 MMOK

C 00000.0000 0 00000.0000 0 00000.0000 0 0 0 0

C 00001.3612 1 00000.0000 0 00000.0000 0 1 0 0

C 00001.4516 1 00120.8429 1 00000.0000 0 2 1 0

C 00001.4911 1 00114.2632 1 00000.0000 1 3 2 1

C 00001.3822 1 00122.9996 1 00000.0000 1 4 3 2

N 00001.3703 1 00122.7138 1 00000.0000 1 1 2 3

C 00001.4565 1 00127.1411 1 00179.9999 1 5 4 3

S 00001.7113 1 00119.6629 1 00180.0000 1 7 5 4

C 00001.6641 1 00094.5950 1 00179.9999 1 8 7 5

C 00001.3825 1 00131.1573 1 00000.0000 1 7 5 4

C 00001.3730 1 00111.4614 1 00000.0000 1 9 8 7

O 00001.2381 1 00123.7857 1 00179.9999 1 3 2 1

O 00001.3655 1 00110.2180 1 00179.9999 1 4 3 2

H 00000.9620 1 00109.9470 1 00000.0000 1 13 4 5

H 00001.1068 1 00122.1498 1 00179.9999 1 1 2 3

H 00001.0976 1 00121.4678 1 00179.9999 1 2 1 6

H 00000.9934 -1 00119.1660 1 00000.0000 1 6 1 15

H 00001.0896 1 00122.5264 1 00179.9999 1 9 8 7

H 00001.0913 1 00128.5097 1 00000.0000 1 10 7 5

H 00001.0927 1 00125.4514 1 00000.0000 1 11 9 18

0 1 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 2 2.3 2.5

r; Å	ΔН°; кДж/моль
1,1 1,2 1,3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 2.1 2.2 2.3 2.4	-6.47 -8.38 1.1 13.21 26.29 39.42 52.13 64.14 75.26 85.30 94.11 39.83 41.43 44.79 49.9

Графік залежності ентальпії утворення від довжини зв'язку:

Зображення молекули у локальному максимумі енергії утворення

Висновок: МОРАС дає можливість моделювати утворення внутрішньо молекулярних водневих зв’язків та спостерігати за утворенням стабільних станів молекул. Дуже корисна програма, недоліком якої є відсутність інтерфейсу користувача, що призводить до певних труднощів у користуванні.

20.03.12

Дата добавления: 2015-10-21