А-белок (393 а.о., 38 кДа, 1 штука на вирион, вирион – вирусная частица) – вход в клетку

Белок оболочки (БО; 130 а.о., 14,7 кДа, 180 штук на вирион) – защита генома

Полимераза/репликаза (РЕП; 545 а.о.) – воспроизводство генома

Белок лизиса (помогает вовремя выйти из клетки) – 75 а.о. в смещенной рамке считывания: перекрытие БО (на 1 п.н. в триплетном цикле) и репликаза, с малой вероятностью (0,0001) рибосома «сбивается» с синтеза БО на синтез белка лизиса

Как организовано воспроизводство?

состав вирусной частицы (вириона): геном (+РНК = инструкция для синтеза белков клеточными рибосомами) + А-белок + 180 БО

А-белок «втаскивает» в бактерию геном (остальное не нужно, даже мешало бы, например, репликаза не пакуется) и это запускает сначала трансляцию – синтез белков, сначала БО (пропуская А-белок), потом репликаза

Репликаза синтезируется не первой – после БО (можно интерпретировать как контроль качества: экологический аспект – не портить зря материал, «этологический» аспект – не мешать воспроизводству на «правильной» +РНК в той же клетке). Если БО нормальный, то синтезируется полимераза (расплетается блокирующая шпилька).

А-белок синтезируется, пока не заплетена шпилька в начале участка, который кодирует его синтез

Сборка вириона: А-белок самопроизвольно связывается с +РНК, конденсирование и структурирование РНК,

(Д)

За время цикла воспроизводства (до лизиса) 30–60 мин образуется более 10000 дочерних вирусных частиц

Интрига: репликация (синтез генома) и трансляция (синтез белков) несовместимы (мешают друг другу), происходят с различных концов РНК, репликаза «сталкивает» рибосомы

Подробности: синтез комплементарной цепи возможен только с 3’-конца (Макеев, рис. 4, с.25; фосфатную группу можно присоединить только к нему), а трансляция происходит с 5’-конца

(!) следствие: большое количество репликаз (своих /ценных белков) фатально для воспроизводства вируса

Регуляционное решение в этой связи: синтез репликазы ингибируют БО (репрессором является димер БО – блокирует посадку рибосом на начало участка РНК, кодирующего репликазу) и сама репликаза

(!) прекращение синтеза репликаз регулирует увеличение количества БО (который не сможет синтезироваться, если репликаз много; а не «естественная» обратная связь по избытку репликаз)

+разрешение «антагонизма» (теоретическое предсказание и экспериментальный факт): преимущественная посадка репликаз на –РНК (сразу решает еще две проблемы – мало –РНК, которая нужна вирусу только как промежуточная форма + экономия материала)

= посадка на +цепи (комплекс с Ef Tu, Ef Ts, и белком S1, который обязательно входит в состав рибосом) дискриминирована в сравнении с посадкой на –цепи (комплекс с Ef Tu, Ef Ts)

тогда качественно всё, вроде бы, хорошо (хотя не разрешились загадки – что делать с избытком репликаз и почему такая странная регуляция?), но без количественного подтверждения нет оснований считать, что действительно понимаем происходящее

Дата добавления: 2015-07-16