Читайте также:
|
|
Триггер. Примеры систем с двумя устойчивыми стационарными состояниями. Конкуренция. Силовое и параметрическое переключение триггера. Отбор одного из двух и нескольких равноправных видов. Генетический триггер Жакоба и Моно.
Важной особенностью биологических систем является способность к переключению из одного режима функционирования в другой. Возможности генной инженерии позволили направленно изменять структуру сети метаболических реакций, что приводит к «переключению» стационарного режима работы живой системы. Проводимые исследования предоставили примеры переключений в работе живых организмов, вызванных мутациями. Примеры переключения процессов в живых системах:
• Сон и бодрствование — это разные типы метаболизма. Переключение происходит периодически и синхронизируется геофизическим ритмом.
• У большинства насекомых один и тот же организм может существовать в виде гусеницы, куколки, бабочки. Переключение происходит последовательно и регулируется включением (экспрессией) определенных генов в соответствии с генетической программой.
• Дифференцировка тканей — клетки получаются путем деления из одного типа клеток, но впоследствии, после экспрессии соответствующих генов, клетки специализируются и каждая из них выполняет свои функции.
На фазовой плоскости триггерной системе в простейшем случае соответствует два или несколько устойчивых стационарных решений, разделенных сепаратрисами. Напомним, что все особые точки лежат на пересечении главных изоклин — изоклин вертикальных и горизонтальных касательных.
На рис. 3.1 представлен относительно простой фазовый портрет триггерной системы, описывающей явление конкуренции двух равноправных видов
Рис. 3.1. Фазовый портрет триггерной системы, описывающей явление конкуренции между двумя равноправными видами
Соответствующая система уравнений имеет вид:
(3.1)
Такая система имеет четыре стационарных решения:
1. неустойчивый узел;
2. седло;
3. устоичивыи узел;
4. устоичивыи узел
Бистабильная система может иметь более сложную структуру фазового портрета. Пример такой системы — движение шарика в ложбине с двумя лунками в присутствии трения (Чернавский, 2001).
Рис. 3.2. Фазовый портрет системы (3.2) (шарик в ложбине с двумя лунками). Темным обозначена область притяжения стационарного состояния (+1).
Система описывается уравнениями
(3.2)
В такой системе три стационарных состояния. Состояние х = у = 0 — седло. Два других стационарных состояния (0, -1) и (0, +1) — устойчивые фокусы. Вблизи этих стационарных состояний траектории представляют собой закручивающиеся спирали. Вдали от стационарных состояний области притяжения имеют слоистую структуру. Толщина слоев уменьшается при уменьшении параметра а.
Как видно из приведенных выше примеров, в триггерных системах поведение во времени и стационарное решение зависит не только от параметров, но и от начальных условий.
Способы переключения триггера
Слово триггер означает переключатель. Встает вопрос: как в терминах кинетической модели можно переключить триггер из одного стационарного состояния в другое?
Рассмотрим фазовый портрет системы, обладающей двумя устойчивыми стационарными состояниями (рис. 3.3). Здесь а, с — устойчивые стационарные состояния, b — седло.
Если начальное положение изображающей точки расположено левее сепаратрисы седла (пунктирная линия), система находится в области притяжения особой точки а и со временем стремится к этому устойчивому стационарному состоянию. Из точек, лежащих правее сепаратрисы, система будет двигаться к особой точке с. Рассмотрим возможные способы переключения системы из режима а в режим с.
Рис. 3.3. Триггерная система. Жирными линиями показаны главные изоклины. Пунктирной линией обозначена сепаратриса, отделяющая области влияния двух устойчивых стационарных состояний а и с. Двойная стрелка показывает процесс силового переключения триггера.
1. Силовое переключение. Можно изменить значения концентраций (например, добавить определенное количество вещества Δх, так что система «перепрыгнет» через сепаратрису, например в некоторую точку с1 которая находится по правую сторону сепаратрисы в области влияния устойчивого стационарного состояния с, к которому система перейдет сама с течением времени. На фазовом портрете на рис. 3.3 силовое (специфическое) переключение показано двойной стрелкой. Кинетика переменных при таком переключении показана на рис. 3.4.
Рис. 3.4. Поведение переменных во времени при силовом переключении после добавления в систему вещества х в количестве, достаточном для переключения системы из режима а в режим с.
2. Параметрическое переключение. Другой — неспецифический — способ переключения показан на рис. 3.5, 3.6.
При таком способе переключения непосредственному воздействию подвергаются не переменные, а параметры системы. Это может быть достигнуто разными способами, например, изменением скорости поступления субстрата, температуры, pH.
Сущность такого способа переключения состоит в использовании зависимости фазового портрета системы от управляющего параметра. На рис. 2.12 показан процесс рождения двух устойчивых узлов и седла между ними из одного устойчивого узла (бифуркация типа «сборка»). Рис. 3.5 иллюстрирует обратный процесс — слияние двух устойчивых узлов и седла в один устойчивый узел.
Пусть с изменением параметра фазовый портрет претерпевает последовательность превращений, показанных на рис. 3.5. На стадии (в) устойчивый узел (а) и седло (b) сливаются в одну полуустойчивую точку седло-узел. На стадии (с) в системе остается лишь одно устойчивое стационарное состояние, к которому и сходятся все фазовые траектории.
Тогда система, находившаяся в начале процесса переключения в стационарном режиме а, в результате параметрического переключения окажется в области притяжения единственного устойчивого стационарного режима с, куда она с течением времени и перейдет (рис. 3.6).
Рис. 3.5. Параметрическое переключение триггера. Последовательные стадии трансформации фазового портрета. Стрелками обозначено направление фазовых траекторий.
Рис. 3.6. Кинетика изменения переменных в процессе параметрического переключения триггера.
Параметрический способ переключения реализуется при изменении любой генетической программы, он может также иметь место при изменении внешних условий, приводящих к изменению управляющего параметра системы.
Дата добавления: 2015-11-26; просмотров: 154 | Нарушение авторских прав