Читайте также:
|
По полученным данным с помощью программы Openoffice Calc было вычислено абсолютные значения количества динуклеотидов(16) для каждого гена. Так как длина одинаковых генов у различных организмов разная, следовательно количество динуклеотидов будет различное, поэтому абсолютные значения были переведены в процентные. Затем вычислена разность процентного содержания динуклеотидов в парах «человек-паразит» и «человек-контроль» (взятая по модулю) для определения сходства по определенному динуклеотиду (нулевое значение указывает на абсолютное сходство). Для оценки динамики коэволюционных изменений вычислена разность «человек-паразит» - «человек-контроль». Отрицательные значения указывают на динамику увеличения сходства по данному динуклеотиду. Чем больше количество отрицательных значений, тем более выражена коэволюция паразита с организмом хозяина по исследуемой нуклеотидной последовательности.
Разработанная методика анализа была применена к исследуемым плоским червям. В таблице 1 приведены результаты для всех генов, рассчитанные по разработанному алгоритму, описанному выше.
Таблица 1 — Процент отрицательных значений для плоских червей
| F. hepatica, % | E. granulosus, % | T. solium, % | |
| НАДН-дегидрогеназа 1 | 37,50 | 18,75 | |
| НАДН-дегидрогеназа 6 | 75,00 | 43,75 | 43,75 |
| Цитохром-с-оксидаза 1 | 31,25 | 18,75 | 18,75 |
| Цитохром-с-оксидаза 2 | 56,25 | 43,75 | 43,75 |
| Цитохром-с-оксидаза 3 | 62,50 | 37,5 | 31,25 |
| Цитохром b | 37,50 | 37,5 | 31,25 |
Чтобы оценить значимость различий, полученные данные были обработаны с помощью критерия Манна-Уитни (статистический непараметрический метод анализа двух независимых групп). Статистически значимые различия выявлены в паре «T. solium — F. hepatica» (р < 0,05). В парах «E. granulosus — T. solium», «E. granulosus — F. hepatica» статистически значимых различий не выявлено.
Разработанная методика анализа была применена для паразитических круглых червей. В таблице 2 представлены значения для Trichinella spiralis и Enterobius vermicularis.
Таблица 2 — Процент отрицательных значений для круглых червей
| T. spiralis, % | E. vermicularis, % | |
| НАДН-дегидрогеназа 1 | 81,25 | 25,00 |
| НАДН-дегидрогеназа 6 | 87,50 | 43,75 |
| Цитохром-с-оксидаза 1 | 87,50 | 12,50 |
| Цитохром-с-оксидаза 2 | 81,25 | 37,50 |
| Цитохром-с-оксидаза 3 | 75,00 | 25,00 |
| Цитохром b | 81,25 | 37,50 |
С помощью критерия Манна-Уитни выявлены статистически значимые различия (р < 0,01).
Выводы
1. Разработанная нами методика позволяет оценить зависимость коэволюционных изменений от степени контакта паразита с тканями организма хозяина.
2. Данная методика, оперирующая с динуклеотидным составом, может быть использована в качестве нового экспресс-метода в области исследований молекулярной
эволюции, в частности, в области эволюции макромолекул.
3. У гельминтов, имеющих более тесный контакт с тканями организма хозяина наблюдаются более выраженные коэволюционные изменения.
4. Эхинококк занимает промежуточное положение между печёночным сосальщиком и свиным цепнем.
ЛИТЕРАТУРА
1. Damian, R. T. Molecular mimicry revisited / R. T. Damian // Parasitology Today. September. — 1987. — P. 263–266.
2. Основные методы молекулярной эволюции: монография / А. В. Бутвиловский [и др.]; под общ. ред. проф. Е. В. Барковского. — Минск: Белпринт, 2009. — 216 с.
3. Частная паразитология: учеб.-метод. пособие / В. Э. Бутвиловский [и др.]. — Минск: БГМУ, 2007. — Ч. 25. — 107 с.
4. National Center for Biotechnology Information. /ncbi.nlm.nih.gov/.
УДК 612.66-053.51:502+911.375.227
Дата добавления: 2015-10-28; просмотров: 73 | Нарушение авторских прав
| <== предыдущая страница | | | следующая страница ==> |
| ОЦЕНКА ГЕОМЕТРИЧЕСКИХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ КАРДИОИНТЕРВАЛОГРАММЫ, | | | Материал и методы исследования |