Как пользоваться лабораторией

Интерфейс разделен на две основные части: Интерактивное окно слева и блокнот лаборатории справа, где и расположена данная страница. В то время как интерактивное окно будет подсказывать Вам с помощью текста в нижнем окне пурпурная стрелка укажет нам на предметы, которые необходимо взять (применить). Во время Вашей работы блокнот лаборатории автоматически будет снабжать Вас детализированной информацией о соответствующем шаге. Названные пункты находятся в нижнем окне и показывают соответствующий шаг (выделяются красным цветом). Вы можете перейти к любому шагу с помощью соответствующей ссылки, чтобы начать заново шаг нажмите на соответствующую ссылку. В любой момент Вы можете «кликнуть» полезные ссылки, которые тут же обновят информацию в блокноте лаборатории и покажет ссылки в глоссарий, инструменты используемые в лаборатории и энциклопедии бактерий и других патогенов. Кликнув «блокнот» Вы вернетесь к информации о соответствующем шаге.

Часть первая: Подготовка образцов

Ключ качественного определения начинается с успешной пробы. Многие патогенные бактерии не растут на плотных культуральных средах, поэтому определить пробу традиционными путями сложно. (Почему -> 1)

1) Ограничения в традиционных методах определения культур.

Десятилетиями ряд тестов развивался, с целью определить и охаректизовать различные виды бактерий. Тест включает посев и выращивание бактерий в различных условиях. Такие процедуры обычно требуют точного и надежного способа выращивания бактериальных культур. Многие патогены плохо растут на плотных культуральных среда, в то время как другие растут только в жидких культурах, поэтому определить вид патогена с помощью традиционных методов сложно или невозможно. С помощью молекулярного метода данные ограничения могут быть преодолены. Некоторые виды бактерий не могут быть дифференцированы от близких им видов с помощью традиционных методов. Для этих видов молекулярный метод предлагает единственный надежный и удобный способ определения.

Даже плохо растущие бактериальные культуры, могут быть определены с помощью метода применяемого в этой лаборатории. В этой лаборатории Вы будете превратитесь в патологиста или возможно сотрудника патологической лаборатории в хорошо оснащенной больницы.

Ваша задача определить бактериальные образцы полученные из клиники.

Для этого Вам нужно вырастить бактериальные колонии в плотной культуральной среде в чашке Петри, первый шаг вырастить единственную колонию и пересеять ее в микроцентрифужную пробирку. Процесс выделения бактериального ДНК состоит в расщеплении клеточной стенки с лизирующим раствором, находящимся в банке с белым колпачком, состоящим в наборе ПЦР. Буфер содержит протеолитические энзимы, которые «поедают» стенки клеток. Этот шаг может занять несколько часов. С Прежде чем приступить к использованию другого энзима в следующем шаге, нам нужно освободить пробу от протеолитических энзимов. Энзим денатурируемый с помощью нагревания образца в воде 100^оС. Дальше клеточная мембрана оседает при центрифугировании и представляет собой однородное включение в виде шарика внизу пробирки.

ДНК помещенное в supernatant, которая потом переливается в ПЦР пробирку.

ЧастьII ПЦР амплификация

Дата добавления: 2015-08-26