Рибосомальная РНК

Виртуальная лаборатория ПЦР

Виртуальное определение бактерий

Введение

Добро пожаловать в виртуальную лабораторию идентификации бактерий. Цель лаборатории ознакомить Вас с научными подходами и технологиями которые используются для определения различных видов бактерий основанных на очередности их ДНК.

Еще недавно определение очередности ДНК было нудным и занимающим много времени процессом. С появлением оборудования и инструментов это перестало быть рутиной. Методика используемая в этой лаборатории имеет различные применения, в том числе для научных исследований и судебных разбирательств.

Основные шаги:

- Возьмите пробу и выделите целую ДНК бактерии.

- Размножьте уникальные кусочки ДНК

- Разберите ДНК код

- Проанализируйте очередность цепочки ДНК и определите бактерию.

Кусочек ДНК который используется для идентификации бактерии эта та часть в которой закодирована маленькая единица подъединицы рибосомы РНК (16S рРНК). Мы рассмотрим эту часть как 16S рДНК. Различные виды бактерий имеют уникальные 16S рДНК – очередности. Определение основывается на сравнении очередности Вашей пробы и базы данных всех известных 16S рДНК очередностей. (Узнайте больше о рибосомальных РНК)

Рибосомальная РНК

Рибосомы – это органоид клетки в котором синтезируется белок. Они находятся в числе самых основных органоидов и находятся как у прокариот так и эукариотических организмов.

Цитоплазма прокариот содержит десятки тысяч свободных рибосом. Рибосомы состоят как из протеинов, так и из кусочков РНК. Рибосомы прокариот сообщает 70S (S=единица Сведберга, которая описывает количество осадка образующегоса в течении центрифугирования, которая зависит от размера, веса и формы частицы). 70S рибосомы состоят из двух частей - 50S и 30S – каждая часть содержит различный набор протеинов и моллекул рРНК. Менишая (30S) содержит 16S рРНК моллекул, а большая (50S) содержит 5S и 23S рРНК моллекул. Данная лаборатория описывает способ определения бактерий с помощью последовательности генома, который закодирован в 16S рРНК.

Определение целей:

- Какой Вид проб может использоваться для идентификации возможных патогенов?

- Что делает ПЦР, как она происходит, и почему она так полезна?

- Как можно выделить желательный ДНК из других?

- Как происходит автоматизирование ДНК очередности?

- Почему возможно использовать ДНК очередности для определения бактерий?

В процессе использования программы окно покажет информацию объясняющую Ваши действия. Все действия, тем не менее будут проводиться внутри графического окна слева. Маленький белый квадрат внизу графического окна будет давать особые инструкции какой объект следует выбрать.

Дата добавления: 2015-08-26