Основные свойства транскрипционных факторов суперсемейства FUR

Белки суперсемейства FUR широко распространены у прокариот. В настоящее время известно около 10000 последовательностей, принадлежащих 4091 видам различных бактерий и архей (Fillat, 2014). Упрощенная модель наиболее распространенного механизма действия белка Fur заключается в специфическом связывании димера Fur в комплексе с металлом-кофактором в качестве корепрессора с палиндромными А/Т богатыми последовательностями, находящимися в промоторе контролируемых генов (Bagg, Neilands, 1987). Связывание кофактора вызывает конформационные изменения белка-регулятора, что способствует его стабильному взаимодействию с ДНК. Несмотря на структурные различия, белки суперсемейства имеют общие черты строения. На N-конце они содержат ДНК-связывающий домен, а на С-конце – регуляторный металл-связывающий участок, способный к димеризации (рис. 1; Pohl et al., 2003). Как правило, белки этого суперсемейства содержат богатую гистидиновыми остатками область HHHXHX₂CX₂C, расположенную в начале димеризационного домена – после шарнирной области между N-концевым ДНК-связывающим доменом и С-концом (http://pfam.xfam.org/family/PF01475). Менее консервативный мотив CXXC находится на С-конце некоторых ортологов белка Fur, а также у всех белков Zur и PerR, идентифицированных к настоящему времени.

Белки суперсемейства FUR обычно регулируют экспрессию собственного гена; однако, обнаружены и другие факторы, влияющие на уровень их внутриклеточной концентрации. Как правило, в клетке активно несколько белков данного семейства с различными функциями (Hantke, 2001; Fuangthong, Helmann, 2003; Botello-Morte et al., 2013), и в связи с этим часто образуются функционально значимые перекрывания регуляторных областей генов, кодирующих эти белки (Horsburgh et al., 2001; Fuangthong et al., 2002; Hernandez et al., 2004; Hohle, O’Brian, 2010).

Наиболее активно исследуемыми и хорошо изученными представителями описываемого суперсемейства являются белки Fur (прототип семейства с огромным количеством ортологов), основная функция которых заключается в регуляции поглощения клеткой железа.

Дата добавления: 2015-07-12