Студопедия
Случайная страница | ТОМ-1 | ТОМ-2 | ТОМ-3
АрхитектураБиологияГеографияДругоеИностранные языки
ИнформатикаИсторияКультураЛитератураМатематика
МедицинаМеханикаОбразованиеОхрана трудаПедагогика
ПолитикаПравоПрограммированиеПсихологияРелигия
СоциологияСпортСтроительствоФизикаФилософия
ФинансыХимияЭкологияЭкономикаЭлектроника

Российская академия медицинских наук медико-генетический научный центр 4 страница



Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ 3.1. Характеристика больных.

Больные с МЭХД были распределены в четыре основные группы:

1. Больные МЭХД с семейной формой наследования заболевания. К этой группе были отнесены одиннадцать семей с МЭХД, всего 47 человек, из них 28 больных. На рис. 5 представлены родословные семей с обозначением пробандов, которые были протестированы на предмет выявления точковых мутаций в ходе ЗБСР-анализа и анализа гетеродуплексов. Помимо ДНК из периферической крови, у пробандов 3 и 4 из семьи 3, а также у пробанда 12 из семьи 11 в исследование были взяты образцы операционного материала.

2. Больные МЭХД со спорадической формой заболевания. Вторая группа наиболее многочисленная и объединяет 22 больных, которые в тексте обозначены как пробанды с 13 по 34. У восьми пробандов (18, 19, 21, 22,23, 26, 31, 34), помимо ДНК из лимфоцитов, исследовалась ДНК из операционного материала.

3. Больные МЭХД с экзостозами, претерпевшими злокачественную трансформацию (в хондросаркому или остеогенную саркому). Эта группа представлена тремя больными МЭХД, у двоих произошла трансформация экзостоза в хондросаркому (проб. 36, проб. 37), у одного - в остеобластому (проб. 35).

4. В четвертой группе исследовали ДНК из крови и операционного материала 9 больных со спорадическими злокачественными новообразованиями. Из них у четырех определена остеогенная саркома (проб. 38, 40, 41, 42), у двоих - остеогенная саркома с выраженным хондрокомпонентом (проб. 39, 44), у троих - хондросаркома (проб. 43,45, 46).

Такая классификация основана на различиях в подходах при детекции мутаций у больных. Подробно эти различия будут рассмотрены ниже.

Таким образом, в работе было обследовано 46 больных, у 25 из них помимо ДНК из периферической крови, исследовали ДНК из операционного материала.

Семья 1.


Семья 2. Семья 3.


Семья 4.


 

 


Семья 5. Семья 6.


Семья 7. Семья 8.


 

 


Семья 9.


Семья 10.


Семья 11.


 

Рис. 5. Родословные семей с МЭХД.

3.2. Стратегия поиска мутаций в генах ЕХТ1 и ЕХТ2 в различных группах больных.

При исследовании первой группы больных, а именно семей с наследственной формой заболевания, на первом этапе проводили анализ высокополиморфных маркеров в семьях в целях определения гаплотипа для выявления сцепления заболевания с хромосомой 8 либо 11, на которых картированы гены ЕХТ1 и ЕХТ2 соответственно. После установления сцепления проводилось тестирование экзонов выявленного гена с использованием БЗСР- анализа и анализа гетеродуплексов. Если сцепление выявить не удавалось, тестировали оба гена. Для исключения или подтверждения больших перестроек в районах локализации генов ЕХТ1 и ЕХТ2 проводили блот-гибридизацию гидролизованной геномной ДНК (использовали ферменты рестрикции Нтсй11, Тад\ и ЕсоШ) с рядом ДНК-зондов. Один из ДНК-зондов представлен смесью очищенных в полиакриламидном геле амплифицированных экзонов гена ЕХТ1 для выявления перестроек затрагивающих этот ген. Для исследования области локализации гена ЕХГ2 использовался клон кДНК Ш4096, содержащий значительную кодирующую часть гена и фрагмент З'нетранслируемого района. Для анализа предположительно регуляторного района транскрипции гена ЕХТ1 был использован ранее клонированный нами ДНК-зонд 49С2Н14.



Наиболее трудоемкой для исследования является вторая группа больных со спорадической формой заболевания. В этой группе тестировали оба гена с использованием БЗСР-анализа и анализа гетеродуплексов, а также проводили блот-гибридизацию с указанными ранее ДНК-зондами. Для больных, у которых был в наличие операционный материал, проводили анализ состояния зиготности локусов 8q24.1 и 11р12. При выявлении потери гетерозиготности (ПГ) в материале экзостоза в определенном районе тестировали ген, локализованный в этом же районе.

При исследовании третьей и четвертой группы больных - больные МЭХД с экзостозами, претерпевшими злокачественную трансформацию и больные со спорадическими формами злокачественных новообразований - в первую очередь проводили анализ состояния зиготности локусов 8q24.1 и lip 12 с использованием высокополиморфных ДНК-маркеров D8S67, D8S522, D8S592, D11S903, D11S1319. Такой подход основывается на накопленных к настоящему моменту знаниях о функции и возможной роли генов ЕХТ1 и ЕХГ2 как генов- супрессоров опухолевого роста. Согласно 2-х ударной модели канцерогенеза, предложенной Knudson в 1971 году, предполагается, что для перехода нормальной клетки в опухолевую необходимо два последовательных мутационных события. Первым событием является мутация, приводящая к образованию клетки, которая обладает повышенным риском возникновения опухоли. Такие мутации могут возникать как в соматических, так и в половых клетках. Вторым событием, происходящим в соматической клетке, является мутация в неповрежденном аллеле гена и превращение клетки в злокачественную. В связи с этим можно предположить, что у больных 3 группы с экзостозами, претерпевшими злокачественную трансформацию, процесс озлокачествления начался в клетках экзостоза, то есть в клетках с уже поврежденным одним аллелем одного из генов ЕХТ в результате соматической мутации в нормальном аллеле. Соматическая мутация может быть точковой, однако чаще происходит потеря всей хромосомы, что, как правило, выявляется при исследовании злокачественных новообразований. Аналогичный подход был осуществлен и для больных со спорадическими формами злокачественных образований. После выявления потери гетерозиготности по тому или иному локусу, проводилось тестирование экзонов соответствующего гена методом SSCP-анализа для выявления терминальной или соматической мутации, являющейся первым событием в 2-х ударной модели Knudson, в результате которого в последствие началось развитие злокачественной опухоли. Помимо этого, также как и в других группах, для обнаружения структурных перестроек в районах локализации генов ЕХТ1 и ЕХТ2, проводили блот-гибридизацию с указанными ранее зондами.

Поиск точковых мутаций в генах ЕХТ1 и ЕХТ2 проводился с помощью методов: SSCP-анализа и анализа гетеродуплексов. SSCP-анализ наиболее


чувствителен при размере фрагментов, не превышающих 300 п.н. В связи с этим были сконструированы синтетические олигонуклеотидные праймеры для кодирующей части генов ЕХТ1 и ЕХТ2, а также для их промоторной области (рис. 6). Ген ЕХТ1 состоит из 11 экзонов, причем первый экзон составляет 1735 п.н., поэтому для него были сконструированы 7 пар праймеров для семи перекрывающихся между собой фрагментов. Ген ЕХТ2 состоит из 15 экзонов, первые два экзона 1а и 1Ь принимают участие в альтернативном сплайсинге и представляют собой 5'нетранслируемый район, поэтому они исключены из общего скрининга. Второй экзон достаточно велик, составляет 566 п.н., поэтому для этого района были сконструированы две пары праймеров. В случае, если продукты амплификации превышали 300 п.н. для проведения БЗСР-анализа амплификаты подвергались обработке ферментами рестрикции для увеличения чувствительности метода. Последовательности праймеров, условия проведения ПЦР и ферменты рестрикции приведены в таблице 1.


 

Рис. 6. Экзон-интронная структура А. Гена ЕХТ1 и В. Гена ЕХТ2. Кодирующая область генов обозначена черным.

Таблица 1.

Праймеры для скрининга мутаций в генах ЕХТ1 и ЕХТ2.

ПРАЙМЕРЫ

размерПЦР -продукта

(П.О.)

Температура отжига/конц. М%С\2 (С/шМ)

Фермент рестрикции

ГЕН ЕХТ1

ВХТ1-ргР: ССТССАООССССОССОСОССТ ЗХП-ргЫ.: ССАОООСОООСОАОСАОСООА

 

72/7.0

 

31 -101 Г: ААОАССОААООООАОАААОТ 31-101К: ОАОСАООАТОАААТАОСОТТ

 

59/2.0

 

31-102Г: ТАСАООСОООААОАТОССОО 11-102Я: ОССАТТССТАССОСТОТОТТСТ

 

65/2.0

 

31-103Г: СТТТТ0ТТТТАТТТС00А00СТ 31-10311: ССТТТОТАОАТОСТСОАОТТС

 

60/1.5

 

31-104Р: СССТТСОТГССТТ<3<ЮАТС 11-10411: ОАСАААОАООСАСОССТС

 

58/2.0

 

31-105Р: АСАОСАААААООООАОААААТС 51-105Я: АООООААТАОАААСАТСАААОТ

 

60/1.5

Нра II

11-106Р: ТТТАТАТТССООСАСТТСОС 31-10611: ТСССТОТСАООТАССТСТТСС

 

58/2.0

 

П-107Р: ТТСААСАССАТСССТССТС 11-10711: СААООСТОАСТСССАААОАС

 

58/3.0

 

И-2Р: СССАСАТТСОСААТвАОТСТТС 11-2Я: ААСССАСТТААТСТООСТТС

 

54/1.5

 

П-3¥: ТТССТСАСАТТСАСОААОТС 51-ЗЫ: АААОТТТОАСОООООСАОС

 

54/2.5

 

21-4Р: ТОАТСААСТОСАТСТСТТТО 51-411: ССААТСАСАСАТСССТААТАО

 

52/2.0

 

 

E1-5F: TGATTCAGCATCATCCTTTCC E1-5R: TCAGGGTAAACAAGGGCAAC

 

58/1.5

 

E1-6F: CTTTCCAGCGCTTCATTAGG E1-6R: GTAAGGAGGGCGGAGTCTCT

 

58/1.5

 

21-7F: GGCGTACATAAATACATCCTACCCC E1-7R: CCAAGGCTCCACAGTGGTTCC

 

64/6.0

 

31-8F: GGGAGAATTGTCCTGAAAAC E1-8R: ACCTGCTGCTCCTCAGG

 

54/2.0

 

E1-9F: CACTGTTGATTGCTTGTTTGGC Ï1-9R: GTAAAGTCTGTAAGAGACATGTCC

 

58/5.0

 

Î1-10F: GATAATGGCCCCCTGTGA il-lOR: CCAGTGAGTGAAGCAAGGAA

 

58/1.5

 

31-1 IF: TTCTGCAATGTTTCCATCT il-llR: AAGCCGGATTCCTCAA

 

50/1.5

 

ГЕН EXT2

ïXT2-prF: GCCCCTCGCTCGCTGCTCGCC ïXT2-prR: GCGGAGGGCGGAGGGCGGGTC

 

70/7.0

 

Î2-2(1)F: AAGTGTCATTTGCCATCCTA < 2-2(1)R: TCCACGTACTTTTTCAGAGC

 

54/1.5

TaqI

•2-2(2)F: TGACTGGAATGTAGAGAAGC Í2-2(2)R: TTCCCTTTAGTTCCCTGAGG

 

53/1.5

Taq I

Í2-3F: GTTGACACATTAATTCTCCCA Í2-3R: GAACAAAATGATCTTGAACCC

 

55/2.5

 

Í2-4F: GTAATTCCTGTTCCTCTCCAC Î2-4R: TTGCTTTGATGCCCACCAC

 

57/1.5

 

Í2-5F: GCAATTTTCCAATCACCTG)2-5R: CCTGAGCCTTTGCGAGAGG

 

54/1.5

 

2-6F: CTAGTTTGTAATCTCTTGCCTCT;2-6R: TACGCAGAACCACTAATGTAGAG

 

55/5.0

 

 

Е2-7Р: ОАТОТТСТТТСТССТТСте Е2-711: САТТААТТТССТТТСОТТТ

 

50/2.5

НрЫ

Е2-8Б: ТСТАСТТТТСССАСТСТСТСТС Е2-8Е: ТТССТТССАСССАСССТСАС

 

59/2.5

 

Е2-9Р: СТСАОССАТАТТетТАСАОС Е2-9Я: ТСАОАААТСОТАТТССТАТТСА

 

54/2.5

Нра II

В2-10Р: ТСАТССТТТТАСТАСТТТАТСТС В2-1011: САССТТТТСОАСТСТАСТСОА

 

56/2.5

Тщ\

32-1 И7: ОААТОСТТОСТСТСТСААТТСОО 32-11 Я: ТСТСТСАОТТТТСТСАССТТССС

 

55/4.0

 

22-12Р: СТАААОООААСТССТАТТТТТС 32-1211: ААТСТСАССОСАТСААТСАТА

 

54/1.5

БаиЗА1

32-1ЗБ: СТССТТОАСАСШАСАОССАОО 12-13Я: ТАОАОАТСАОАСОСТААООСОС

 

58/4.5

 

}2-14Б: ТТССТОТТАТСТСТСААССТС £2-14К: САСССТТААССТАСТАСТСТС

 

56/1.5

Бёе!

 

При выявлении аномальных сигналов в ходе проведения Б8СР-анализа и анализа гетеродуплексов, образец фрагмента ДНК подвергали очистке в полиакриламидном геле и проводили прямое секвенирование для выяснения изменений в последовательности ДНК, лишь после этого делалось заключение либо о наличие мутации в данном образце, либо о выявлении полиморфного аллеля. В случае выявления миссенс-мутации для исключения полиморфизма тестировали 30 неродственных индивидов. Для подтверждения выявленного изменения проводили рестриктный анализ, если в результате мутации появлялся или исчезал сайт узнавания какого-либо фермента рестрикции.

3.3. Исследование больных с наследственной формой

МЭХД.

3.3.1. Анализ полиморфных ДНК-маркеров в семьях с МЭХД.

Поскольку МЭХД является генетически гетерогенным заболеванием, было целесообразным провести определение гаплотипа в семьях с наследственной формой заболевания. В настоящее время известно три основных локуса, связанных с развитием МЭХД: 8q24.1, lip 11.2 и 19р 13.1. Поскольку целью данной работы было определеление мутаций в генах ЕХТ1 и ЕХТ2, расположенных в районах 8q24.1 и lip 11.2, соответственно, был использован ряд высокополиморфных ДНК-маркеров, картированных в этих районах. При выборе ДНК-маркеров предпочтение отдавалось маркерам, фланкирующим область локализации генов ЕХТ, учитывался также показатель гетерозиготности и количество описанных для каждого маркера аллелей. Таким образом, для исследования были выбраны следующие ДНК-маркеры: высокополиморфный СА-повтор D8S522, картированный на расстоянии 600 т.п.н. дистальнее гена ЕХТ1, тетрануклеотидный (GATA)n повтор D8S592, расположенный на расстоянии 650 т.п.н. проксимальнее гена ЕХТ1, тетрануклеотидный (СТТТ)п/(ССТТ)п повтор D8S67, картированный на расстоянии в 60 т.п.н. от 3' конца гена ЕХТ1 и два локализованные на хромосоме 11 СА-повтора: D11S903 и D11S1319. Последовательность праймеров, условия амплификации и длина ПЦР- продукта приведены в таблице 2.

Таблица 2.

ПРАЙМЕРЫ

Размер ПЦР- продукта (п.о)

Температ. отжига/ конц. MgC12 (С/шМ)

D8S67F: ACGTGTACTCAGGGCACAGAGC D8S67R: GCAATGGTGGAGCAAAGCAC

230-288

59/1.5


 

088522Р: ОААААСААААСАООСТСС 08852211: ТОАССАААСААСТАОАСАСС

203-217

55/2.0

Б88592Б: Т АОАТАОАТв АТОТГСТТОТГОАТО Б88592К: ОАСТОААТАТАТОТССТОТТООС

149-156

55/1.5

Б118903Р: ААСАСТТСОАТОТТССТТСС 011890311: АОСТОАОАОСОСАТОТАТАА

99-109

55/2.0

Б1181319Р: ОАААТГСССТАСТООАААСА Б1181319К: АААТСТСАСАТТТОСАТТСА

182-200

52/2.0

 

При составлении гаплотипов для простоты маркеры 08867, Б88522, 088592, Б118903 и Б1181319 были обозначены А, В, С, О и Е соответственно. В каждой семье самый тяжелый аллель обозначался как первый и т.д.

Проведенный анализ позволил установить сцепление! заболевания с хромосомой 8 в семьях 3, 6 и 9 (Рис. 7, 8, 9.). В остальных семьях этот анализ оказался неинформативным.

Таким образом, было установлено, что поиск мутаций в семьях 3, 6 и 9 целесообразно проводить в гене ЕХТ1. Образцы ДНК больных из семей 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10 и 11 тестировались по обоим генам.

А1 А2 А1 А2

В2В1 В2В1

С1 С2 С1 С2

БЮ1 Б2 Б1

Е1 Е2 Е1 Е2

Семья 6.



Семья 3.


а2 а2 в1 в1

сз с2

Б1 В2 е1 е2

а1 аз в1 в2 с2 сз

01 е1 е1

А1 а2 В1 в1 С1 с2

Б1 т е1 е2

А1 а2 В1 вз С1 СЗ

т т

е2е2

А1 а1 В1В1 С1С2

ОЮ1

е1 е1


 


 


Семья 9.



 


 


аз аз АЗА5 в2 в2 В1 в2 с2с1 с1с2

т т б1 бз

АЗ а6 В1 в4 С1 с2

б1бз е1 е1

АЗ аз В1 в2 С1 с1

Б1 Б2 е1 е2

АЗ аз В1 в2 С1 с2

т бз

е2 е1

Рис. 7. Гаплотипы трех семей с МЭХД.

е2е2 е1е1

А)

г\



 


 


285 п.н.

.щ—260 п.н. >. — 254 п.н.


 


 


В)

/ "V

п.н.


 

А 286

.254 <«250

-4 236

Рис. 8. Анализ семей с МЭХД с использованием маркера Б8867: А) семья 6, В) семья 9. Электрофорез в 6% ПААГ, радиоактивная детекция.


1Пр.З


 


 


Пр.4


 


 




 


 


2.


Пр.4(


Пр.З


 

 


 

Рис. 9. Анализ полиморфных маркеров в семье 3. 1)маркер Б8867, 2)маркер Б88592. Электрофорез в 10% ПААГ, нерадиоактивная детекция.

3.3.2. Поиск мутаций в генах ЕХТ1 и ЕХТ2 у больных с наследственной формой заболевания.

В скрининг по выявлению мутаций в генах при помощи ББСР-анализа и анализа гетеродуплексов был взят образец ДНК одного пробанда из каждой семьи. После выявления аномального сигнала анализировали ДНК других больных и здоровых членов семьи. Окончательный вывод о природе аномального сигнала делался после секвенирования интересующего образца.

В результате проведенного анализа мутации в гене ЕХТ1 выявлены в восьми семьях, все мутации установлены при помощи ББСР-анализа, в гене ЕХТ2 выявлены две мутации - одна в результате ЗБСР-анализа в семье 4, другая - в семье 1 в результате блот-гибридизации с ДНК-зондом 1114096. Все мутации описаны впервые. Точковые мутации приведены в таблице. Далее представлено подробное описание мутаций.

Семья 1.

В семье 1 больны отец и ребенок. В ходе проведения БЗСР-анализа и анализа гетеродуплексов кодирующей части генов ЕХТ1 и ЕХТ2 каких-либо изменений подвижности однонитевой ДНК либо образования гетеродуплексов выявлено не было. Однако, при проведении блот-гибридизации зонда кДНК Ш4094, который несет значительную часть кодирующей области гена ЕХТ2, с ДНК пробанда 1, гидролизованной по Нтсй11, выявлен атипичный тяжелый сигнал 5.5 т.п.н. наряду с нормальной гибридизационной картиной (сигналы 5.0 т.п.н., 3.8 т.п.н., З.б.т.п.н., З.О.т.п.н.) что может свидетельствовать о делеции около 10 т.п.н., затрагивающей один аллель гена ЕХТ2 (Рис. 30). Именно поэтому не удавалось выявить мутацию на уровне тестирования экзонов, очевидно, что выявленная перестройка и является причиной заболевания в семье 1.

Семья 2.

Была обследована семья 2, состоящая из трех человек. Больна мать и ребенок. При анализе ДНК больного ребенка методом ББСР был обнаружен фрагмент однонитевой ДНК с аномальной подвижностью в первом экзоне гена ЕХТ1. При тестировании соответствующего фрагмента ДНК из периферической
крови больной матери выявлен аналогичный аномальный сигнал, в то время как у здорового отца он отсутствовал. В результате секвенирования определена инсерция двух нуклеотидов ТТ в позиции 742 нуклеотидной последовательности, что приводит к сдвигу рамки считывания и преждевременной терминации синтеза белка - образованию стоп-кодона в 252

позиции белковой последовательности (Рис. 10).


 

Нормальная последовательность: AGG АСА GGA GGG GAG AGG GGG ITT TTG AAG

1 экзона гена

R T G G E R G F L К Мутантная последовательность: AGG АСА GGA GGG GAG ATT GGG GGT TTT TGA R T G G E / G G T *

Рис. 10. Результат SSCP-анализа и прямого ЕХТ1 в семье 2.

Семья 3.

В семье 3 больны два ребенка и мать, причем наблюдается нарастание симптомов заболевания у детей. Мать не испытывает больших неудобств в связи с заболеванием, экзостозы у нее были выявлены при рентгенологическом исследовании по причинам, не связанным с МЭХД, в то время, как у детей экзостозы активно растущие, особенно тяжелое течение заболевания наблюдается у пробанда 3. В исследование взяты образцы операционного материала пробанда 3 и пробанда 4, причем у пробанда 3 анализировали ДНК из двух различных экзостозов, удаленных с разных конечностей в разное время.

При анализе полиморфных ДНК-маркеров Б88522, Б88592 и Б8867 установлено, что причина заболевания связана с изменениями в гене ЕХТ1 (Рис.7).

При анализе гетерозиготности по микросателлитному маркеру 08867, расположенному в непосредственной близости от 3' конца гена ЕХТ1, выявлена потеря гетерозиготности в материале одного из экзостозов пробанда 3 (Рис. 11). Логично предположить, что данный экзостоз мог претерпеть злокачественную трансформацию. Может оказаться, что именно активно растущие экзостозы наиболее подвержены процессу озлокачествления.

В ЩШШя ^ И^^^Н ^ '4

1 2 3 4 5

Рис. 11. Анализ состояния зиготности гена ЕХТ1 по маркеру Б8867: 1 - пробанд 4 (кровь), 2 - пробанд 4 (экзостоз), 3 - пробанд 3 (кровь), 4 - пробанд 3 (экзостоз I), 5 - пробанд 3 (экзостоз II).

При проведении анализа гетеродуплексов и SSCP- анализа экзонов, как гена ЕХТ1, так и гена ЕХТ2, выявить каких-либо изменений в семье 3 не удалось. В результате блот-гибридизации с ДНК-зондами для генов ЕХТ1 и ЕХТ2 так же каких-либо перестроек выявлено не было. В связи с этим был проведен анализ состояния района, расположенного со стороны 3'конца гена ЕХТ1, для чего был использован ранее клонированный и охарактеризованный в нашей лаборатории маркер 49С4Н14, картированный на расстоянии 60 т.п.н. от З'конца гена ЕХТ1. При изучении этого маркера было показано значительное количество сайтов связывания для факторов транскрипции таких как NF-A3, CTF1, Oct3, Oct5, характерных для регуляторных районов. При проведении блот-гибридизации маркера 49С2Н14 с ДНК пробанда 3 и ДНК из его экзостоза выявлены отличные от нормы сигналы (Рис. 12) как в крови, так и в материале экзостоза. При гибридизации ДНК из лимфоцитов пробанда 3, гидролизованной по Taql, выявлены атипичные легкие сигналы 2.5 т.п.н., 1.2 т.п.н. наряду с нормальными 3.7 т.п.н. и 2.3 т.п.н., что свидетельствует о появлении дополнительного сайта узнавании фермента рестрикции Taql в одном из аллелей. В гибридизационной картине экзостоза наряду с легкими атипичными сигналами, определенными в ДНК лимфоцитов, выявлена потеря нормального сигнала 3.7 т.п.н., что свидетельствует о делеции, затронувшей второй аллель, не поврежденной в лимфоцитах. В пользу соматической мутации в экзостозе пробанда 3 свидетельствует результат блот-гибридизации ДНК из операционного материала пробанда 3, гидролизованной по Seal, а именно отсутствие в гибридизационной картине ДНК из экзостоза нормального сигнала 3.6 т.п.н., присутствующего как в ДНК из лимфоцитов больного, так и в норме. Поскольку при гибридизации по ■Seal каких-либо изменений в гибридизационной картине ДНК из лимфоцитов больного не обнаружено, в то время как по Taql изменения были выявлены, логично предположить, что наследуемая в семье 3 терминальная мутация представляет собой микроструктурную перестройку, приводящую к образованию дополнительного сайта узнавания для фермента рестрикции Taql. Таким образом, полученные результаты свидетельствуют в пользу того, что причиной заболевания наряду с мутациями и перестройками в кодирующей части генов ЕХТ1 и ЕХТ2, по-видимому, могут оказаться перестройки в регуляторных районах, приводящие к нарушению нормальной транскрипции генов.


А) 1

#2.0т.п.н.

Щ 4.5 т. п. н.

43.6 т.п. н.

41.От.п.н.


1 2 3

3.7т.п.н.

<4^1. 2т. п. н.


 

■Й9


 


 


С)


Seal

Терминальная мутация

Seal

Рис. 12. А) Результат блот-гибридизации маркера 49С2Н14 с ДНК гидролизованной по БсаЪ 1- норма; 2- экзостоз; 3- лимфоциты пробанда 3. В) Результат блот-гибридизации маркера 49С2Н14 с ДНК гидролизованной по ТацI: 1- норма; 2- экзостоз; 3- лимфоциты пробанда 3. С) Схема структурной перестройки.

В литературе описан целый ряд генов, для которых выявлены перестройки, затрагивающие районы, значительно удаленные от 3'конца генов, и приводящие к изменению транскрипции этих генов. Данные изменения в транскрипции генов относят на счет активно изучаемого в настоящее время феномена, названного эффектом положения (ЭП), который можно определить, как нарушение уровня экспрессии гена в результате изменения местоположения гена в структуре генома либо изменения окружения гена, но не ассоциированного со структурной патологией или мутацией, затрагивающей кодирующую часть гена и его промоторную область (Кагреп, 1994, М1Ы е1

делеция 3.7-3.8 т.п.н.


al.,1996). Одним из первых генов, для которого описан ЭП, является ген РАХ6, расположенный в районе хромосомы lip 13 и изменения в котором приводят к возникновению аниридии. В пяти случаях у больных были выявлены транслокации, точки разрыва при которых были локализованы в 100-125 т.п.н. от 3' района гена (Fantes et al., 1995).


Дата добавления: 2015-08-27; просмотров: 41 | Нарушение авторских прав







mybiblioteka.su - 2015-2024 год. (0.049 сек.)







<== предыдущая лекция | следующая лекция ==>